よくブログなどで自作の漫画（４コマ程度の）やイラストを見ますが、どういった方法で書いているんでしょうか？

人により様々だと思います
私の知っている範囲だと、
・紙に線画を描いて、スキャナで取り込み、パソコン上で色付けや補正をする人
・ペンタブレット(中にはマウスで描く強者もいます)を使って直接パソコン上で描いていく人
が多いですね。
完全に色付けまで紙で行って、最後にスキャナで取り込む人もいるみたいです。