ブログで日記を一部削除したのですがArchivesの方には残っているのですが、そこは削除されないのでしょうか。

全体を再構築してみてはどうでしょうか？
たぶんそれで消えると思います。

基本的にコジーさんの回答のように全てのページを再構築すれば直るはずです。




補足

投稿した記事の日付を月をまたがって変更した場合は元々の月のアーカイブに記事が残ってしまう事があります。たとえば、８月の記事を９月の日付に変更した場合は、８月アーカイブから記事が消えず、９月には新たに追加されてしまいます。この状態で記事を削除しても９月アーカイブからしか削除されません。８月分には残ってしまう。このような状態になっていても８月アーカイブを再構築すると直ります。

こういった現象は、記事を削除したり編集した場合は、その記事に関係する箇所しか再構築されないからです。ですので、記事の投稿日の月を変える場合は別途、月別アーカイブを再構築する必要があります。


過去の質問も参考に…
「削除したはずの記事が消えません」


「投稿日時（月）を変更したのに、変更前の月別アーカイブに記事が残っているのですが…」