送料無料になる個数を注文したがカートで見ると無料になっていない

最終決済の直前まで進めば分かると思います。

途中ではこういうことが良くあります。

直前まで行って×なら、注文しないでくださいね。

バーゲン品は含まないとか、種類が違うとか、個数の計算にもっと、条件はないのでしょうか？

条件がなければ、途中では、単純な計算しかしていない可能性もあります。
もし、注文確定の前に、確認できるところがまだあるのであれば、そこまで進んで、確認してみれば、料金が正確に出てくる可能性もあります。

最終確認で直っていなければ、プログラムされていないのだと思いますから、送料を払う覚悟がない限り、やめたほうが良いと思います。