この質問は、３０日間解決しなかったために自動的に質問が一旦閉じられました。

livedoor Blog ProもMTも使っていないので、コメント欄にて失礼します。
レンタルサーバにインストールしたMTに、現在のブログの内容を移行したいということでよろしいでしょうか？
方法は2つあります。

1. 有料版にアップグレードしてエクスポート機能を使う。
2. 記事の編集画面を1つずつ開いてコピペしていく。

1のエクスポートについてはこちらを参照してください。
http://helpguide.livedoor.com/help/blog/qa/grp447#...

記事数が少なければ無料版のままできる2の方がおすすめです。

質問の文面に照らし合わせると、

その移行時に、全ページの再構築が必要になってしまうので

インポート側のMTでは必要かもしれませんが
エクスポート側のライブドアでは不用だと思います。

今まで広告が表示されていなかったページにも広告が表示されるようになってしまいますよね？

ライブドア側は再構築とは無関係に広告が入っているので、エクスポートで更に広告が増えることはないと思います。
広告はエクスポートしたデータには含まれないので、MTに広告が入ってしまうこともないです。

それを回避するにはどうしたらいいか

そのままで回避できます。

有料版に一端して、広告を非表示にすればいいのでしょうか？

広告を非表示にする必要はありません。
ただしエクスポートするには有料版にする必要があります。

＞それを無料版に戻した時にはまた過去記事にも広告が表示されちゃいますか？

恐らくそうなりす。

トラックバックURL: