ロリポップレンタルサーバーにロリポFTPというのがありますが、NEXTFTPなどのFTPソフトは使わないで良いのですか？

こちらを見る限りFTPソフトも利用可能なようです．

同ページにNEXTFTの設定方法も掲載されてます．

実際に使っていないので詳細は不明ですが．ロリポFTPというのは，POP/SMTPメーラーに対するWebメーラーみたいなものでしょうか．

　済みませんが、ロリポップレンタルサーバーに聞いてください。

ファイルマネージャーというのがあって、FTPソフトを利用しなくても、色々とする事が可能です(これがロリポFTP)。
ですが、それほど使いやすいものではないので、FTPソフトを使った方がいいですけどね(あくまで私の主観的な意見ですが)
*ファイルマネージャーもFTPソフトもどちらね使えます。