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３カラムなのに、トップページだけ表示がされない。

３カラムにしていたのですが、いつからかトップページだけが、キレイに表示されず、プラグインのAもしくはBが下のほうに表示されてしまいます。
プラグインの確認をしたのですが、コメントのページではキレイに３カラムの表示がされているので、問題ないとおもいます・・・
何が悪いのでしょうか。。

トップページに記事は何件ありますか？
１つづつ個別ページに入って、サイドが落ちているページがありますか？
その場合は、大きい画像やタグのミスがないか確認。
その他、カスタマイズしていますか？
実際に見せてもらった方が早いかも知れません。