プラグインを設定しても１ページのトップに表示されずページの最後に記載される。これでは何の役にも立たないので。どうしたらトップに出せるか？

カスタマイズ／管理から、あなたが入れたいプラグインの設定の時に、出来るだけ要らないと思う前からのを削除して、あなたが希望しているプラグインの表示順序を上位の１とかに変更（数字を入れるだけ）すればいいと思うけどどうかな？ただ新しく作っただけだと当然これまでの後の順位となるよー。

ひとまずブログの再構築を試してみて下さい。


それで修正されない場合は、画像やブログパーツなどが記事やサイドバーの横幅を超えてしまい、はみ出したことによって不具合出たのかも知れません。
今までのデザインでは収まっていたのが、新しいデザインでは記事幅などが狭くてはみ出してしまったとか。
実際にブログ拝見しないとどこが原因などは指摘できません。