NPO団体を訴え正当な認証を得たい

あるNPO団体に対して、ある事柄の認可を得るためにアプローチしています。
規定通りの書類等はすべて揃え提出しましたが、規定以上のものを提出を要求されたり、規定事項とは違う部分でアクションを要求され、できなければ認証しない、と言われます。
あまりの理不尽さに言葉もなくします。
訴える方法はありますか？
また正当な認証を得る方法はありますか？

その非営利団体がどのような性質のものなのかわからないのでなんともいえませんが、一般論としてはNPOは自己統治であり自発的であることが求められている正規の組織ですので、その団体がなんらかの公的？な認証を行っているとしても、それはその組織の自発的な判断（→独自の判断→勝手な判断）によるわけで、それを当該団体や団体関係者以外が指導したり判断を強制したりする類のものではないと思いますが。

NPOは非政府組織であることも条件に言われるので、行政からの働きかけで動かすようなものでもありません。

あるとすれば、その団体の自助努力で、組織内部からの声でその団体の規約に基づいた是正がなされることは可能かもしれません。あなたが当該NPOの会員の地位であるならそのことを議案に上げてもう一度再考してもらえばいいと思います。

あなたがそのNPO団体関係者でないなら、認証を得られなかったとしても、それをどこかに訴えて認証させるようにするのは建前論ではお門違いの話です。

ミスコンのエントリーが認められないからといってミスコン主催団体をどこかに訴えることができないのと同じですｗ