全てのページを再構築してもトップページのCommentsをクリックするとサイドバーがずれてたりするのですがどうすればよろしいでしょ
うか？

本文の中に大きすぎる画像を入れていませんか？コンテント(本文スペース)の横幅を超える画像が入っていると、サイドバーが収まりきらず落ちてしまったりします。もしくはコンテントの横幅がもともと大きすぎるのかのどちらかだと思います。