ディスクデフラグについて

WindowsXP SP1を使用しているのですが、
ディスクデフラグではメールフォルダの最適化も同時に行われるのでしょうか。

　常識的に言って、メールフォルダーの最適化は同時にしないのではないかと思います。何故ならば、デフラグはディスクファイルの使用に伴うサイズ変化などでディスク領域のフラグメンテーション（断片化）が進んだ時に、断片化したファイルを連続化することでパソコンのディスクI/O動作の高速化とディスク容量の効率利用をはかるものです。ハードウェアー・レベルの最適化です。

これに対して、メールフォルダーの最適化はもっとソフトウェアー・レベルの最適化だと思うからです。あくまでも私の意見であり、OS仕様を調べた訳ではありません。

Windowのシステムツールのディスクデフラグはハードディスクの物理的なアドレス分布の断片化を低減するものであって、フォルダの樹構造を識別して最適化するものではありません。

私は別だと思うのですが、どうなんでしょう。

同時に行われないと思います。

なぜなら、

ディスクデフラグはＯＳ上の処理。
メールフォルダの最適化はＯＥ上の処理。

だからです。別物です。

質問で書かれている "メールフォルダ" の言葉の意味合いが分からないのですが．
メールフォルダを構成するファイルがということでしたらディスクデフラグ対象になります．デフラグをしてもメールの内容などには影響しません．

お使いのメールソフトがOutlook Express6でメールを削除しても占有容量が減らないのをなんとかしたいということでしたら，ディスクデフラグではなく，OutlookExpressのツールバーから次の操作をすることで無駄になっている部分を整理してくれます．
　ツール＞オプション＞メンテナンスタブ＞整理するボタン＞最適化するボタン