最初から入っているバナーを消したいのですが、方法がわかりません。

どのバナーのことを言っているのか、この質問では情報が少なすぎて分からないのですが、いずれにしてもライブドアの規約の中にこういう風に書かれています。

■ 利用規約

第8条 （ 禁止事項 ）
利用者は、本サービスを利用して以下の行為を行わないものとします。
( 1 ) 本サービスにより利用しうる情報を改ざん ・ 消去する行為、又は事実に反する情報を送信 ・ 掲示する行為

第5条 （ 禁止行為 ）
livedoor Blog BUSINESS に申し込みせずに弊社が利用者のウェブログに自動的に表示しているリンク、画像を非表示にする行為、もしくはしようと試みる行為

ですから、初めから設定されているバナーなどを、削除やそれに準じる行為は規約違反となり、してはいけません。

してしまえば、急にライブドア側からあなたの運営するブログを削除されても文句は言えないことになります。残念ですが、あきらめて下さい。

カスタマイズのことを言っているのであれば、プラグインの
設定/新規追加を、利用して下さい。これだけでも、けっこう
模様替えが、できます。

　最初から入っているバナーを消すのは規約違反です。

が、もしかしたら、古いデザイン等では、ご希望の、バーなーが
無いものも有るかもしれません。探してみては？