プラグインの文字の色を変えるにはどうしたらいいですか？

スタイルシートの下のほうに

.side{
	color:#41699a;
	font-size:12px;
	line-height:125%;
	padding:5px 7px 0;
}

という具合に

.side{

で始まるところがあります。
この{ }の

	color:#カラーコード;

のカラーコードを変えてください。青なら

	color:#0000ff;

となります。

リンク集などのように文字にリンクが着いているものは、表示される文字の色はリンクのついた時の表示色です。
リンクのついた状態の色は、もう少し下のほうの

.side a{color:#41699a;}
.side a:hover{}

という具合の

.side a

で始まる行の{ }の中のcolor:#カラーコード;のカラーコードを変えてください。

.side a{color:#0000ff;}
.side a:hover{color:#0000ff;}

という具合です。

カスタマイズから入って、スタイルシートをクリックしてください。あとはhorseflyさんの言うとおりです。